首先，棚内消毒要彻底。蔬菜拔园后，菜农为赶茬口，使下茬蔬菜早日上市，大都在拔园后仓促定植，而忽视了大棚的消毒工作，为下茬蔬菜病害暴发埋下了隐患。蔬菜换茬时，一定把棚内的枯技残叶清理干净，并认真做好棚内消毒工作。可在蔬菜拔园后，每亩用硫磺粉1000克加锯末混合，拌匀后分放在棚室各点，将所用农具架杆等也一并放入棚室，暗火点燃后密闭棚室熏蒸 12小时；也可用45%百菌清烟剂每亩用药400―600克熏蒸，熏蒸时需密闭棚室2天消毒灭菌，定植前1-2天打开通风口通风。棚内的土壤也要进行消毒，可用30%的苯噻氰1000倍液或95%的恶霉灵水剂450倍液喷湿地面，然后再定植蔬菜，效果较好。有地下害虫的大棚地，可在蔬菜定植前穴施适量的杀虫剂，以防地下害虫为害。
其次，土壤应深翻。采访中，记者发现不少菜农由于仓促换茬，没有对棚地全面翻耕，而只是对蔬菜种植畦进行了耕翻，这是不提倡的。最好人工深翻一遍，或使用旋耕机对棚地全面翻耕。
再次，基肥必须充分腐熟。冬季气温低，鸡粪堆积在棚外往往发酵不彻底。而深冬期棚室为保温又相对密闭，若施用了这些没腐熟好的鸡粪，很容易造成氨气等有害气体在棚内积聚，从而熏坏蔬菜。因此，蔬菜换茬后在施基肥时，一定要注意察看鸡粪是否已充分腐熟，外观为黄褐色有臭味的为未腐熟的鸡粪，一定要避免施用。为提高腐熟效果，可用1000克肥力高与2方鸡粪拌均，腐熟效果较好。某些含氮量过高的复合肥，也不宜在此期内基施。
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